3.肝组织活检或细胞学检查 近年来在实时超声或CT导引下活检或细针穿刺行组织学或细胞学检查，是目前获得2cm直径以下小肝癌确诊的有效方法。但近边缘的肝癌易引起肝癌破裂，此外，并有针道转移的危险。
    综上所述，若AFP明显升高，加上典型超导图像可初步诊断原发性肝癌；对AFP阴性或低浓度者应适当选择AFP以外的肝癌标志物，影象诊断亦有定性、定位诊断价值，CT检查造影剂增强或动态增强扫描，有助于肝癌诊断。磁共振的特征性表现可助肝癌的诊断和鉴别诊断，放射免疫显象诊断有较高特异性。微小肝癌的诊断和与某些小的良性病变的鉴别尚有待深入研究。
    诊断和鉴别
    肝癌的诊断已从30年代的“死后诊断”进展到“临床诊断”以及70年代的“亚临床诊断”。这一进步与不同时期新的诊断方法问世紧密联系。60年代末AFP检测用于临床使肝癌诊断产生第一次飞跃；80年代电子计算机与新技术结合产生的超声显象、CT、MRI等新的定位诊断方法问世导致肝癌诊断的第二次飞跃。第一次飞跃使肝癌诊断由“临床期诊断”提高到“亚临床期诊断”阶段；第二次飞跃则使亚临床期诊断提高到1cm肝癌水平，而且使临床期肝癌的诊断更为准确，术中超声的应用又使治疗水平有明显提高。由新技术带来的还有概念的更新，“亚临床诊断”的概念已完全更新了过去100年肝癌的诊断概念。
    1）肝癌标记与实验室检查：
　　对血清肝癌标记物已有众多研究，不下几十之多。主要有：①甲胎蛋白（AFP）及其异质体；②各种血清酶，如GGT及其同工酶、ALD-A、AFU、AAT、ALP-Ⅰ、5’-NPD-V、PyK、GST等；③其他标记如DCP、铁蛋白与酸性铁蛋白等。但迄今为止，在各种肝癌标记物中尚无超过AFP者，尤其对于早期诊断而言，AFP已经约20年验证。但由于我国肝癌者有30%～40％属AFP阴性，为此其他标记物对AFP阴性肝癌仍有其应用价值。